優勢
1、規模經濟效益高：相對于傳統零售藥店，醫藥連鎖經營可以使復雜的商業活動在職能分工基礎上實現相對簡單化，從而獲得低成本、大批量的營銷效益和管理的集約化效應優勢。
2、對供應商還價能力強，成本優勢大：醫藥連鎖企業借助強大的終端市場銷售能力，通過與供應商的討價還價可以使藥品進貨價格比傳統藥店更低廉，從而達到降低成本，提高消費者消費數量與消費滿意度的目的。
3、網絡優勢和信息優勢：連鎖藥店具有強大的網點輻射力和品牌號召力，可以利用現代化管理手段對各分店和配送中心實現計算機管理并建立局域網，從而建立完善的信息溝通網絡，分店定期向總部報告企業的經營狀況，總部根據分店的信息，確定以后的營運計劃，并與分店之間進行不斷地反饋調節，以尋求市場行為的均衡點。
劣勢
1、專業人才資源匱乏：目前我國藥店連鎖經營的藥學服務工作還處于初級階段，大部分從業人員整體水平相對較低，服務范圍狹窄，藥學知識相對缺乏，普遍存在藥品從業人員不具備相關藥學專業背景的現象；同時短時間專業執業醫師的人才輸出有限，尚存在較大數量缺口，難以滿足連鎖藥店經營需求。
2、產業鏈體系尚不完善：長期以來，由于我國醫藥商業過分強調藥品的特殊性、專營性以及國有主渠道作用，把特許連鎖作為擴大連鎖經營的一條捷徑，多關注規模、數量、區域地盤，對連鎖經營的規模化只注重外在形式的統一而忽視內在基礎的建設與控制，導致我國連鎖藥店發展處于“連而不鎖”局面。
3、市場分布不均衡：以執業藥師的區域分布分析，目前由于各省配備政策不一，各省市執業藥師數量差距較大，我國連鎖藥店區域整體分布較為分散。
隨著國家食品藥品監督管理總局加大流通零售領域監管力度，連鎖藥店靠打政策擦邊球生存將是窮途末路，不規范的連鎖藥店必將被淘汰出局。
也就是說，藥店并購重組將成為趨勢，這也預示著很多的單店和不規范的藥店將會被逐漸淘汰，連鎖藥店逐漸增多，對于連鎖藥店的經營也會逐漸趨向規范化。
且連鎖藥店的上游為藥店供貨商，主要供貨商為醫藥制造企業，另外還有少量的醫療器械制造企業、保健食品制造企業和藥妝、日用品制造企業等。中游連鎖藥店已經逐漸呈現規模化和集中化，但頭部市場集中度較低，仍屬于競爭性行業。連鎖藥店主要面向人群為消費者，根據消費者的不同需求為消費者提供藥品、醫療器械以及保健食品等，由于面向受眾廣闊，消費群體龐大，連鎖藥店議價能力相對較高，利潤率也較藥品批發要高上許多。
1、選址的區別
個體藥店：個體店長在選址時時常會碰到這樣的困擾，擔心盤下因虧損出兌的藥店；擔心選的位置客流有問題難以盈利；和房東談房租時不擅長話術以高價租下商鋪；忙碌奔波幾天，跑了幾個地方都沒有找到合適的店鋪等等。
連鎖藥店：連鎖店品牌能夠以老練的技巧給店鋪的選址做一份全面專業的選址服務，讓加盟店長以一個相對輕松的狀態度過選址期，專心店面籌備工作。
2、裝修的區別
個體藥店：因為不懂裝修細節，所以免不了要和裝修師傅斗智斗勇，甚至每天到店親自盯著裝修，也有可能會因為個人原因或者溝通不暢導致最后店面裝修效果難以被消費者接受，影響店面盈利。
連鎖藥店：門店統一裝修，一對一設計門店，為連鎖店提供門店專屬的平面設計圖，以千家門店成功經驗為店長們把好門店裝修關。
3、開業的區別
個體藥店：因為缺乏相關經驗，個體店長們往往是模仿當地其他藥店的開業方式，甚至干脆就沒有像樣的開業活動，對店員也沒有標準化、系統化的培訓，導致周邊顧客對店鋪的第一印象不深、不好。
連鎖藥店：開業前期，總部會指派專業外派店長對門店進行一系列開業指導，包含店員培訓、開業活動、收銀系統操作等，還會為不同門店定制個性化的開業方案，根據現有資源靈活分配試營業、正式營業時間，以一個相對成熟的狀態開啟店面營業，不放過每一個為店面盈利的機會。
4、節點促銷的區別
個體藥店：大多是模仿當地其他店面，少數是店長按照自己的主觀想法原創促銷方案，容易出現同質化、不接地氣、消費者不買賬、盈利少等問題，甚至對店面盈利起到反效果。
連鎖藥店：運營團隊會為加盟店長提供成熟的店面活動方案，提供活動相關的海報等物料，復制千家門店成功案例，在店鋪正式營業開始便為加盟店長提供優質、可靠、持續、穩定的促銷活動方案。
1、直營連鎖
總公司直接參與經營和管理的連鎖店，即由公司本部直接經營投資管理各個零售店的經營形態，此連鎖模式并無加盟店的存在。它主要任務在于“渠道經營”，即由公司總部直接經營、投資、管理各個零售店的經營。其所有權和經營權集中統一于總部，所有成員企業必須是單一所有者，歸一個公司，一個聯合組織或一個人所有。
2、特許經營也叫特許加盟
特許人和受許人之間形成一種契約關系，從而向受許人提供的一種商業經營許可，并給予人員藥店經營各方面的指導與幫助，受許人按照合同的相關規定，在特許者的統一管理下從事相關業務活動，受許人向特許人支付相應的費用。
3、自由連鎖也叫自愿加盟
一批所有權相對獨立的商店自愿歸屬于一個采購聯營組織和一個管理中心領導。管理中心負責提供貨源、推銷計劃、賬目處理等。自愿加盟體系中，商品所有權是屬于加盟主所有，而運作技術及商店品牌則歸總部持有。
品牌優勢：大藥房品牌知名度高，深得消費者的認可。
生產優勢：設計專業、優化，質量可靠。
模式優勢：采購模式統一，降低采購本節約采購費用。
團隊優勢： 加盟商會幫你宣傳，幫你搞促銷。
管理優勢：井然有序，有條不紊，開拓進取。
政策優勢：享有總部的品牌效應、信譽效應和媒體宣傳效應。
1、醫藥連鎖公司、醫藥零售藥店、藥師、醫師、醫藥界從業人員或一般人士。
2、一定的資金實力，有能力支付加盟金、提高/增加金、權利金、店面智慧之選、營運流動資金。
3、嚴格遵守醫藥零售政策法規，和國際知識產權保護條例。
4、嚴格遵守加盟合同，維護加盟品牌信譽。
5、認同公司的經營理念、經營管理技術和要求，并努力學習和執行。
6、了解醫藥零售行業特性，對智慧之選經營、發展過程有合理期望。
藥店加盟費：10-15萬元以上
設備費：5萬元
首批進貨費：3萬元
廣告宣傳費用：1萬元
流動資金：4-5萬元
員工聘請：3000-5000元/月/人
以上費用為預估費用，僅供參考，實際費用還需要進一步咨詢溝通。
1、初步接洽：熟悉項目情況，符合加盟條件且意向加盟者經公司負責人確定后達成協議。
2、提交資料：加盟者須據實提供資料，并以郵件或傳真方式發送給相關人員，經相關人員審核通過后，由客服人員通知進行下一步操作。
3、初步協商：加盟者和大藥房加盟中心負責人面談，進行實地考察以及對加盟者進行資格考查。
4、簽訂意向書：雙方經過交談達成協議并且簽訂加盟意向書之后，公司會根據相關的章程來收取一定的加盟保證金。
5、店面選址：總部會協助合作商選址和確認商圈，以及店面裝修的一些布置。
6、簽訂合同和特許經營授權：加盟者與大藥房雙向考查合格者，由工作人員通知雙方，簽訂加盟合同，大藥房給予加盟者相應的材料和辦理相應的手續。加盟者與大藥房簽訂相應在特許經營合同。
7、準備開業：開始嘗試營業，做一些推廣活動。
8、營銷培訓：達成合作之后，總部可為加盟商帶來免費學習機會，或者您也可以自找機構學習提升。
9、工程督導：為了達到格調裝飾品質、形象、品牌等各類要求，來自總部的督導師將被派往去指導和監督工程工藝、質量、材料和工地VI形象。
10、開業運營：總部會持續關注加盟者的經營動態，開業后總部會根據加盟店實際情況，必要時會派人上門親自指導。
開一家藥店必須辦理國家規定的相關證件，一個是憑藥師證到當地藥品監督管理部門辦理藥品經營許可證和醫療器械經營許可證，然后再需要到當地衛生監督部門辦理衛生許可證，最后到工商局辦理營業執照、稅務登記證、衛生許可證。
1、門店氣氛烘托的渲染
如用一些彩色氣球烘托貨架、天花板;在藥店內擺放一些綠色植物或塑料花卉植物，給顧客一種清新宜爽的感覺，還可以將企業經營的理念、宣傳話語合理地融合進去。門店內裝飾物品的擺放一定要注意色彩的搭配，注意與企業文化和季節變化的匹配。門店氣氛的烘托還需要店員的精神面貌的配合，以及門店的清潔衛生保持。同時還可以播放一些音樂或釋放一些好聞的氣味來渲染門店環境。
2、產品促銷推廣和信息發布融入門店銷售氛圍提升之中
產品的門店廣告宣傳和促銷活動的信息發布的有效利用，可以使死板的門店修飾氛圍立刻活躍起來，包括產品的海報、產品堆頭、花車賣架、紙架、易拉寶等POP宣傳，還包括一些耐用性的產品宣傳，如門店的門頭、背景墻、燈箱、櫥窗、專柜等區域進行產品形象的包裝和宣傳，這是門店銷售氛圍提升“動”的因素。
3、特價藥品信息發布是門店銷售氛圍提升的畫龍點睛之筆
藥店往往會利用一些知名品牌產品進行特價銷售來吸引顧客，形成終端銷售氛圍提升的焦點。特價產品的促銷信息發布標識一定要簡單、明了、醒目，太多文字的標識不利于顧客仔細閱讀，特價標識應該讓顧客一目了然，對于傳達特價產品的種類與價格的文字或圖案應用強調性強的色彩來表現，標識的色調應保持一致，最好不要超過3個色彩。復雜、花哨的語句，會讓顧客不知所云，效果反而差。
特價產品一定要選擇顧客認知度高的品牌產品。在產品同質化嚴重的今天，不要寄希望特價會給非品牌產品帶來銷量，非品牌產品應更加注重自身產品的品牌塑造和市場推廣。特價產品一定是擁有較大的消費人群的產品，需要顧客對產品十分熟悉，尤其是對產品的價格敏感度高。
稅收由各地當地地科局征收，有兩種計費方法，一種是包干的，不管你每月的實際營業額多少，繳納的稅費都一樣，具體要多少錢，由稅務局核定。
另一種計費方式是按照實際的營業額進行計算，多營業多繳稅，少營業少繳稅。
增值稅。按月不含稅銷售額*4%計算，按月向國稅繳納。
城建稅。按增值稅額*城建稅率（城市7%，縣城、建制鎮5%、其他地區劃%）計算，按月向地稅部門繳納。
個體藥店月營業額在5000元以下的，未達起征點，不征稅。超過5000元的，全額征收增值稅。
中國醫藥集團旗下國藥控股的重點零售戰略板塊，創辦于2004年，國內醫藥零售行業中的中外合資企業。國大藥房業務涵蓋中藥、西藥、中醫、西醫、“5+X”等零售診療創新門店，分別布局全國多個省、市、自治區，形成了輻射華東、華北、華南、東北、西北的藥店銷售網絡。
華南地區頗具影響力的醫藥零售服務提供商，集醫藥制造、零售、批發為一體的大型集團化企業。大參林旗下門店遍布廣東、廣西、河南、河北等國內十個省份，門店多達6000余家。2017年7月31日，大參林正式在上海證券交易所主板上市（股票代碼：603233.SH）。
全國頗具實力的大型藥品零售連鎖企業，滬市主板上市連鎖藥房品牌（股票簡稱：益豐藥房，股票代碼：603939），在湖南、湖北、上海、江蘇等多個省市擁有連鎖藥店數千家，員工20000多人。益豐大藥房積極嘗試多元化經營大健康藥房新業態，目前業務范圍從藥品向保健食品、養生食品、個人護理、母嬰產品等健康關聯的行業延伸。
集中藥材種植、加工，中、西成藥研發、生產、批發、零售連鎖經營以及醫療健康產業為一體的大型股份制醫藥企業集團。一心堂專注于為廣大消費者提供包括藥品、健康產品、快速消費品和健康服務的全產業鏈服務，逐步實現了線上線下一體化的全渠道銷售網絡建設，目前在云南、廣西、四川、山西、上海等多個省、市擁有數千家直營連鎖藥店。
國內知名度較高的醫藥零售服務供應商，由單一民營藥店發展起來的大型醫藥連鎖企業，于2015年4月23日在上海證券交易所成功上市（股票代碼：603883）。老百姓大藥房除藥品零售外，同時兼營藥品批發與制造，并已成功開發了湖南、陜西、浙江、江西、廣西、山東等多個省級市場，擁有大中型門店數百家，經營面積10萬多平方米。
國內直營門店數較多的跨區域藥店連鎖品牌，美國紐交所上市企業，公司為客戶提供高品質、專業、便捷的藥學服務和其他各種商品，包括過度的非處方藥、營養補充劑、草藥產品、個人護理產品、家庭護理產品、以及消耗品、季節性產品和促銷品等。目前海王星辰已在國內多個大型城市設有分支機構，全國門店超數千家。
同仁堂始于1669年，中華老字號，以中醫中藥為主，形成了以制藥工業為核心，以健康養生、醫療養老、商業零售、國際藥業為支撐的五大板塊，公司擁有三十多個生產基地、110多條現代化生產線，可生產2600多種藥品和保健食品，其中安宮牛黃丸、同仁牛黃清心丸、同仁烏雞白鳳丸等一大批王牌名藥家喻戶曉。
國內連鎖藥房新興企業，集實體藥房、藥事服務、B2C、PBM為一體的立體化結構的現代藥房服務體系。全億健康憑借豐厚的資本和優秀的專業化管理團隊，旗下直營藥店零售規模不斷壯大，連鎖藥房遍及華東、華北、西南和華中等地區，門店數及營業額均位于行業前列，總部設于蘇州。
源自1999年，華東地區大型醫藥零售產品供應商，致力于提供中西成藥、中藥飲片、保健食品、家庭清潔用品、醫療器械等相關產品，2021年正式在深交所上市（股票代碼：301017）。漱玉平民現擁有直營連鎖門店達數千家，以商品平價優質、服務專業等特點而享譽業界。
創建于1998年，西南地區知名連鎖藥店品牌，專業從事藥品、保健食品、個人護理品、便利食品、日用消耗品等健康產品的銷售和服務的現代化產業企業。健之佳主營業務覆蓋藥品零售、食品及日用品零售、物流配送、健康體檢等領域，并形成了社區便利型藥房、健康廣場、美信專業藥房、博仁堂中藥房、藥妝店、平價藥店等多種業態，旗下門店數量已達上千家。
